RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	DDC1	Q08949	612 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YLR462W	O13556	202 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YHL049C	P38722	271 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YEL075C	P39972	122 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YER189W	P40104	122 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YFL064C	P43540	174 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	ARO80	Q04052	950 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	PRC1	P00729	532 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	CKI1	P20485	582 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	BCS1	P32839	456 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	SPO74	P45819	413 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YGL140C	P53120	1219 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YML020W	Q03722	664 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	IVY1	Q04934	453 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	CDD1	Q06549	142 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	SEC39	Q12745	709 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	TMT1	P32643	299 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	TDA3	P38758	523 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	SKY1	Q03656	742 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	YML083C	Q04526	418 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	DYS1	P38791	387 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	CEP3	P40969	608 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	MNL2	Q12205	849 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	FIG2	P25653	1609 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	KIN82	P25341	720 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
PDR10	YOR328W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PDR10	YOR328W	GAC1	P28006	793 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TOM22	P49334	152 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
PDR10	YOR328W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PEX2	P32800	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	KTR4	P38131	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	GLG2	P47011	380 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	DAS2	Q12084	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	LDB17	Q12342	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HKR1	P41809	1802 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SAM37	P50110	327 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ATG17	Q06410	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AAD4	Q07747	329 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	THI21	Q08975	551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PMS1	P14242	873 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RPO26	P20435	155 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SLY1	P22213	666 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	VBA3	P25594	458 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ADK2	P26364	225 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	VBA5	P36172	582 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YBR056W	P38081	501 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AGP2	P38090	596 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	OPT2	Q06593	877 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YPR027C	Q12079	277 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YDL206W	Q12424	762 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ECM3	Q99252	613 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	BEM4	P39011	633 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	INA22	P40576	216 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YGR127W	P53275	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MGT1	P26188	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	UBP7	P40453	1071 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MND1	P53102	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ESBP6	P53918	673 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	FAP1	P53971	965 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ADY3	Q07732	790 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HRT3	Q12347	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	FRE1	P32791	686 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	CNS1	P33313	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SRB2	P34162	210 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AVT2	P39981	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TGL3	P40308	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6

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