RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PPN1	Q04119	674 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PIF1	P07271	859 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	HOP1	P20050	605 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	DPB3	P27344	201 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SAW1	P39735	261 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	STL1	P39932	569 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YNL195C	P40168	261 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YIL092W	P40497	633 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	IRC5	P43610	853 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	MSE1	P48525	536 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	TAF4	P50105	388 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SUN4	P53616	420 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	ERG5	P54781	538 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	NSE5	Q03718	556 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	DLT1	Q04216	342 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	MET3	P08536	511 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	IME1	P21190	360 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SEC15	P22224	910 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	DCG1	P32460	244 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PTH2	P34222	208 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SDS22	P36047	338 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	FUI1	P38196	639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YEL076C	P39971	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	EAF5	P39995	279 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	BUD8	P41698	603 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	ASK10	P48361	1146 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SLI1	P53304	468 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	OMS1	Q06668	471 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	VPS36	Q06696	566 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PHO3	P24031	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	KIN82	P25341	720 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YPT7	P32939	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	KTR4	P38131	464 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YHR033W	P38690	423 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YHL041W	P38730	149 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	BIT61	P47041	543 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	MUP1	P50276	574 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YGR021W	P53212	290 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	NUR1	Q12066	484 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	YOL114C	Q12322	202 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	POM34	Q12445	299 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	LAS17	Q12446	633 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	ECM3	Q99252	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PEX1	P24004	1043 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	AIM21	P40563	679 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	MTL1	P53214	551 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PSF3	Q12146	194 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	PHO81	P17442	1178 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	GET2	P40056	285 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	ELO3	P40319	345 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	BAP3	P41815	604 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	QRI7	P43122	407 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
HMS1	YOR032C	MSS18	P08593	268 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	TGL1	P34163	548 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	TAF5	P38129	798 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	LYS9	P38999	446 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	NUP60	P39705	539 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	ACA1	P39970	489 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	IES5	P40060	125 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	SPO1	P53541	631 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	TEP1	P53916	434 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	KIN4	Q01919	800 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	VPS5	Q92331	675 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	PRE4	P30657	266 aa		5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	HOS4	P40480	1083 aa		5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	ARP7	Q12406	477 aa		5.14	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	ERG4	P25340	473 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	CWH43	P25618	953 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	MSH1	P25846	959 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
HMS1	YOR032C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.8 ms