RNA–Protein interactions for RNA: YOL027C

MDM38, Transcript of Mitochondrial protein, yeast

Gene MDM38, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM38	YOL027C	SPC72	P39723	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	IMA5	P40884	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	TAF1	P46677	1066 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	TAF4	P50105	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	MNT2	P53059	558 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	YAP6	Q03935	383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	BLS1	Q06071	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	VPS36	Q06696	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	BEM3	P32873	1128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	APT2	P36973	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	CTH1	P47976	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	GCN5	Q03330	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	PEX19	Q07418	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	RXT3	Q07458	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	SGO1	Q08490	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	DIN7	Q12086	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	MTC7	P32633	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	YNL195C	P40168	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	IML2	P47031	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	MRPL22	P53881	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	RRI2	Q12348	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	TRM11	Q12463	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	CBP3	P21560	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	RPN12	P32496	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	TAF5	P38129	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	PSY4	P38193	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	RPP1	P38786	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	PXA1	P41909	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	BIT61	P47041	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	PEF1	P53238	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	MRPS35	P53292	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	YNR071C	P53757	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	PPN1	Q04119	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	TGL5	Q12043	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM38	YOL027C	SGS1	P35187	1447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CDC20	P26309	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CTF13	P35203	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YHR033W	P38690	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YLF2	P38746	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	UBA2	P52488	636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	NRG1	Q03125	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MCH5	Q08777	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PRE4	P30657	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MCM10	P32354	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	COX18	P53239	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	TRI1	Q05024	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	OPY2	Q06810	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	DFG16	Q99234	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SSM4	P40318	1319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YCL049C	P25577	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	KAR4	P25583	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	CWH43	P25618	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PLB1	P39105	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PRM2	P40534	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	GAD1	Q04792	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ECM3	Q99252	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MTF2	P10849	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	GET2	P40056	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ERG5	P54781	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PHO5	P00635	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	HMG2	P12684	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	XRS2	P33301	854 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	PUG1	P40100	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SPO1	P53541	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	POM34	Q12445	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	URA3	P03962	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	SIR1	P21691	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	ARG1	P22768	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	KIN82	P25341	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM38	YOL027C	LIP5	P32875	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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