RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	PRC1	P00729	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	COQ1	P18900	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	APN1	P22936	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	AGP1	P25376	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SYN8	P31377	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PBY1	P38254	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YBR197C	P38306	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	NDT80	P38830	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GDH3	P39708	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SAE2	P46946	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YML6	P51998	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GTR1	Q00582	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	CDC45	Q08032	650 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RFU1	YLR073C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	CCH1	P50077	2039 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RAD16	P31244	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	OPT1	P40897	799 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	ALR2	P43553	858 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SPO1	P53541	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RFU1	YLR073C	VTC3	Q02725	835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SWA2	Q06677	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MRL1	Q06815	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	ADY3	Q07732	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	ESC8	Q08119	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	NCB2	Q92317	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	POL3	P15436	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	FPS1	P23900	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SEG2	P34250	1132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	UBS1	P38290	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	HXT5	P38695	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	VPS45	P38932	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PFD1	P46988	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PIB2	P53191	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MEP3	P53390	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SFB2	P53953	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SKY1	Q03656	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YLH47	Q06493	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	IRC10	Q08118	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	TAH18	Q12181	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	FUB1	P25659	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	LYP1	P32487	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	BEM3	P32873	1128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	NIP100	P33420	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	BET3	P36149	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	VBA5	P36172	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MCM7	P38132	845 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PSY4	P38193	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	STB5	P38699	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RRF1	P38771	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MGS1	P40151	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RAD26	P40352	1085 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SAD1	P43589	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	ENT3	P47160	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SHE10	P53075	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	HST1	P53685	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	MRPL19	P53875	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RAD33	Q04231	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GAD1	Q04792	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	BLS1	Q06071	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	YRM1	Q12340	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	RMP1	Q12530	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	GCR1	P07261	785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	NUC1	P08466	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFU1	YLR073C	PET111	P08468	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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