RNA–Protein interactions for RNA: YJR130C

STR2, Transcript of Cystathionine gamma-synthase, converts cysteine into cystathionine, yeast

Gene STR2, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STR2	YJR130C	TSC11	P40061	1430 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	AI1	P03875	834 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	MIC60	P36112	540 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PSY4	P38193	441 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PEX7	P39108	375 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	GTS1	P40956	396 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	STU2	P46675	888 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YMR210W	Q03649	449 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YLR407W	Q06070	228 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	INH1	P01097	85 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	HXT4	P32467	576 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	JNM1	P36224	373 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PIM1	P36775	1133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PTC7	P38797	343 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	STL1	P39932	569 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	EAF5	P39995	279 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	IAH1	P41734	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	IES1	P43579	692 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SSY5	P47002	699 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	HOT1	Q03213	719 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	TLG2	Q08144	397 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RTP1	Q12751	981 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	VPS5	Q92331	675 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	HSL1	P34244	1518 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	CDC26	P14724	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	DGR2	P32330	852 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	NGG1	P32494	702 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PPE1	P38796	400 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YHR202W	P38887	602 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	TMA108	P40462	946 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YGR035C	P53222	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ORC4	P54791	529 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	CIA1	Q05583	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ARR1	Q06596	294 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	NUP159	P40477	1460 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	FBP1	P09201	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	CLN1	P20437	546 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RER1	P25560	188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	APM3	P38153	483 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	DUN1	P39009	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	IRC5	P43610	853 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PSR1	Q07800	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
STR2	YJR130C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PHM7	Q12252	991 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ATG19	P35193	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	APN2	P38207	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YHR078W	P38799	552 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	ARO80	Q04052	950 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	GLE1	Q12315	538 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	POL1	P13382	1468 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	CMP2	P14747	604 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	DAL5	P15365	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	TGL1	P34163	548 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	CTF8	P38877	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	HOS4	P40480	1083 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	PRY1	P47032	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SPE1	P08432	466 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	BRF1	P29056	596 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	RAD16	P31244	790 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	TAF5	P38129	798 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	SAF1	P38352	637 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STR2	YJR130C	YEL076C	P39971	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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