RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	YGR151C	P53287	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	THI73	Q07904	523 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	CTP1	P38152	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YEL020C	P39994	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YIL077C	P40508	320 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	BIT61	P47041	543 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	MPS3	P47069	682 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YJR096W	P47137	282 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PMT3	P47190	753 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	VPS36	Q06696	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	ADY2	P25613	283 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YKU70	P32807	602 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YPT7	P32939	208 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	SET3	P36124	751 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	APL3	P38065	1025 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	COS111	P38308	924 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	ARO10	Q06408	635 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YFT2	Q06676	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	BNR1	P40450	1375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
YJR087W	YJR087W	EMP70	P32802	667 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	KHA1	P40309	873 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PXA1	P41909	870 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YGR153W	P48238	217 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	RFX1	P48743	811 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	SPC98	P53540	846 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PPN1	Q04119	674 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	SWI6	P09959	803 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PEX2	P32800	271 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	UME1	Q03010	460 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	NUP145	P49687	1317 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	MUP3	P38734	546 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PAC2	P39937	518 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	IMO32	P53219	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	COQ11	Q05892	277 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	SEC65	P29478	273 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	DUN1	P39009	513 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YJR142W	P47173	342 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	MRK1	P50873	501 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	NMA2	P53204	395 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	SPO1	P53541	631 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	HFD1	Q04458	532 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YPS7	Q06325	596 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	IME1	P21190	360 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	DID4	P36108	232 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	FLO10	P36170	1169 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	BUD8	P41698	603 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	DIP5	P53388	608 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	ECM9	Q02202	377 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	UFO1	Q04511	668 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	RKI1	Q12189	258 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	LAM4	P38800	1345 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YMC2	P38087	329 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	HXT7	P39004	570 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	THI6	P41835	540 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YGR237C	P50089	785 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	TAF4	P50105	388 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	NSE5	Q03718	556 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YHM2	Q04013	314 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	STP4	Q07351	490 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	IZH3	Q07959	543 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	HFI1	Q12060	488 aa		4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	OAF3	P36023	863 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	PMT6	P42934	759 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	IES1	P43579	692 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.9 ms