RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	CHD1	P32657	1468 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	GCN4	P03069	281 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	BET2	P20133	325 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.28	□□□□□ -1.4	not detected
ATG7	YHR171W	PUP2	P32379	260 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	MDL2	P33311	773 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	UBP7	P40453	1071 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	SPO22	P40511	975 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	AAD14	P42884	376 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	GYP7	P48365	746 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	SGF73	P53165	657 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	NNF2	P53253	936 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	VPS75	P53853	264 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	SWA2	Q06677	668 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	SOG2	Q08817	791 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	CIR2	Q08822	631 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG7	YHR171W	CMP2	P14747	604 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.27	□□□□□ -1.41	not detected
ATG7	YHR171W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	STE50	P25344	346 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ADK2	P26364	225 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PRO1	P32264	428 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GCD10	P41814	478 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SIP4	P46954	829 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YPL260W	Q08977	551 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	POL3	P15436	1097 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	APN1	P22936	367 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SED4	P25365	1065 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YKR018C	P36114	725 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MAD2	P40958	196 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	BSC5	P53755	489 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ARP4	P80428	489 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	APC5	Q08683	685 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	FRE6	Q12473	712 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	APE1	P14904	514 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SIR1	P21691	654 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SDH2	P21801	266 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DLD1	P32891	587 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	UIP5	P36137	443 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	UME6	P39001	836 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YEL025C	P39991	1188 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	HST1	P53685	503 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YPL107W	Q02873	248 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ACM1	Q08981	209 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	LDB19	Q12502	818 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	CDC4	P07834	779 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YLR464W	P0CX17	216 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DAL80	P26343	269 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PPQ1	P32945	549 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	CTF13	P35203	478 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ATG14	P38270	344 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YEL076C	P39971	216 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YJR039W	P47107	1121 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YJR098C	P47139	656 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YNR061C	P53747	219 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.25	□□□□□ -1.41	not detected
ATG7	YHR171W	PCD1	Q12524	340 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YLR149C	Q99296	730 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NFS1	P25374	497 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NAS2	P40555	220 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MRX6	P48564	524 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	OAZ1	Q02803	292 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	FDC1	Q03034	503 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	AIM32	Q04689	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YDL073W	Q07454	984 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DIN7	Q12086	430 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DIF1	O13577	133 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MRP10	O75012	95 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RAD51	P25454	400 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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