RNA–Protein interactions for RNA: YGR213C

RTA1, Transcript of Protein involved in 7-aminocholesterol resistance, yeast

Gene RTA1, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTA1	YGR213C	FAT1	P38225	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	BIT61	P47041	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	FHN1	P53279	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	TIM44	Q01852	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	POM34	Q12445	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PHO11	P35842	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	BIT2	P38346	545 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PHO12	P38693	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PCL5	P38794	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	SSL2	Q00578	843 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	TMN2	Q04562	672 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	STP4	Q07351	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	BCS1	P32839	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PAF1	P38351	445 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	SDS3	P40505	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	IES1	P43579	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	MLH3	Q12083	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	HIF1	Q12373	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	TMA17	Q12513	150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PRP28	P23394	588 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	KIN82	P25341	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PIG2	P40187	538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	BUD8	P41698	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	CDC26	P14724	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	DAL3	P32459	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	YBR071W	P38243	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	VID28	P40547	921 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	PXA1	P41909	870 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	NIT2	P47016	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	UBA2	P52488	636 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	VPS72	Q03388	795 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	TRE2	Q08693	809 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	RMP1	Q12530	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTA1	YGR213C	AEP2	P22136	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	MTH1	P35198	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	DUN1	P39009	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	YIL077C	P40508	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	YJR120W	P47157	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	GND2	P53319	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	ATG4	P53867	494 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	SKY1	Q03656	742 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	NSE5	Q03718	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	PPN1	Q04119	674 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	YFT2	Q06676	274 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	INO80	P53115	1489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
RTA1	YGR213C	MRC1	P25588	1096 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	UBS1	P38290	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	COS111	P38308	924 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	NDC80	P40460	691 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	RFX1	P48743	811 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	TAF4	P50105	388 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	COG6	P53959	839 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
RTA1	YGR213C	SPT7	P35177	1332 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	SEC15	P22224	910 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	PRE4	P30657	266 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	ARG2	P40360	574 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	MPS3	P47069	682 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	SPO1	P53541	631 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	IRC10	Q08118	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	USV1	Q12132	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	ATP12	P22135	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	SET3	P36124	751 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	KHA1	P40309	873 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	TAF3	Q12297	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	SWE1	P32944	819 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	GLG1	P36143	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	CTP1	P38152	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTA1	YGR213C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70.6 ms