RNA–Protein interactions for RNA: YBR143C

SUP45, Transcript of Polypeptide release factor (eRF1) in translation termination, yeast

Gene SUP45, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUP45	YBR143C	BEM4	P39011	633 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HOS4	P40480	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	MTH1	P35198	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	OAF3	P36023	863 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	YHL017W	P38745	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HXT7	P39004	570 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	DUN1	P39009	513 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	DAS1	P47005	663 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	GIS1	Q03833	894 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HFI1	Q12060	488 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	YKU70	P32807	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	BCD1	P38772	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	REV7	P38927	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	GID8	P40208	455 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	SDS3	P40505	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	PEX14	P53112	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	SPC105	P53148	917 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	MTL1	P53214	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	IRC10	Q08118	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	ECM3	Q99252	613 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	SWI6	P09959	803 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	KAR1	P11927	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	DAL3	P32459	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	PET127	P32606	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	GRX7	P38068	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	PCL5	P38794	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	YNL195C	P40168	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	STU2	P46675	888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	SKY1	Q03656	742 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	NUP60	P39705	539 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	BAP3	P41815	604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	UBC11	P52492	156 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	COG6	P53959	839 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	APM4	Q99186	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	TFC4	P33339	1025 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	BIT2	P38346	545 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	FMO1	P38866	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	EMP65	P40085	556 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	NIT2	P47016	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	SLD3	P53135	668 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	RIA1	P53893	1110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	PPN1	Q04119	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SUP45	YBR143C	MLP2	P40457	1679 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	PEX1	P24004	1043 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	KIN82	P25341	720 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	HIR1	P32479	840 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	FAT1	P38225	669 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	LYS9	P38999	446 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	FMP52	P40008	231 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	GET2	P40056	285 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	PEA2	P40091	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	VID28	P40547	921 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	PXA1	P41909	870 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	IOC4	Q04213	475 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	YPS7	Q06325	596 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	VPS36	Q06696	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	POM34	Q12445	299 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUP45	YBR143C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

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