RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639496.1

KCNQ3-208, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3, human

TSL 5

Gene KCNQ3, Length 4,943 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ3-208	ENST00000639496	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	ABCC1	P33527	1531 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	ITGA6	P23229	1130 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	KRT2	P35908	639 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496		H7C1D1	291 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	MBD4	O95243	580 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	ATP10A	O60312	1499 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496		A0A1B0GUL7	405 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPTLC2	O15270	562 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	FER	P16591	822 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	SP4	Q02446	784 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	GPR162	Q16538	588 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KCNQ3-208	ENST00000639496	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	IQUB	Q8NA54	791 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PSMD1	Q99460	953 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	UBASH3A	P57075	661 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496		A0A1W2PP64	1363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	SLC8A3	P57103	927 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	LPIN2	Q92539	896 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	DHX58	Q96C10	678 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	SMTN	P53814	917 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZBED4	O75132	1171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	IGHD	P01880	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPP1R2	P41236	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	UQCRH	P07919	91 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC175	P0C221	793 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	TIMM10	P62072	90 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	A1BG	P04217	495 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KCNQ3-208	ENST00000639496	APPBP2	Q92624	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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