RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637500.1

TCF4-287, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-287	ENST00000637500	PBX4	Q9BYU1	374 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500		H3BRJ5	948 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	C1QTNF9	P0C862	333 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	DRD2	P14416	443 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	HOXA5	P20719	270 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	IGFBP4	P22692	258 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	NLRP12	P59046	1061 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	HYAL2	Q12891	473 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	MISP3	Q96FF7	219 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	USP17L3	A6NCW0	530 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	USP17L4	A6NCW7	530 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	PTPRA	P18433	802 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	ABL2	P42684	1182 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CYP27A1	Q02318	531 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	MLANA	Q16655	118 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	RELT	Q969Z4	430 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	NFKBIE	O00221	500 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	USP11	P51784	963 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	GGN	Q86UU5	652 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	TREML1	Q86YW5	311 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	SPACA7	Q96KW9	195 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	NFIC	P08651	508 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SEC13	P55735	322 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	VAV3	Q9UKW4	847 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	PSPN	O60542	156 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	CD96	P40200	585 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	NFKB2	Q00653	900 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	PRKCQ	Q04759	706 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	CD320	Q9NPF0	282 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SOX13	Q9UN79	622 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	LGR5	O75473	907 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	WEE1	P30291	646 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	CABP4	P57796	275 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	MAP7	Q14244	749 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	KCNMB1	Q16558	191 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	FYB2	Q5VWT5	728 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	NETO1	Q8TDF5	533 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	UCN2	Q96RP3	112 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500		U3KQE9	123 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ATP9B	O43861	1147 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SCNN1A	P37088	669 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	FAM26D	Q5JW98	314 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	COX20	Q5RI15	118 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	HINFP	Q9BQA5	517 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	NFIB	O00712	420 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	FOXO3	O43524	673 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	MED14OS	P0DP75	135 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ADH5	P11766	374 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	ARL4D	P49703	201 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	KCNA10	Q16322	511 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TCF4-287	ENST00000637500	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94

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