RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280		A0A0G2JLW4	131 aa		19	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		19	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		19	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	MCM4	P33991	863 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	PKP1	Q13835	747 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	NEK1	Q96PY6	1258 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	LARGE1	O95461	756 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ST5	P78524	1137 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	MAP3K12	Q12852	859 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	GRAP	Q13588	217 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	KLRK1	P26718	216 aa		18.98	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	NUCB2	P80303	420 aa		18.98	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		18.98	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	CRY2	Q49AN0	593 aa		18.98	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		18.97	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.97	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	FGA	P02671	866 aa		18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	DOCK2	Q92608	1830 aa		18.96	■□□□□ 0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ANKRD1	Q15327	319 aa		18.95	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ME3	Q16798	604 aa		18.95	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280		E7EWF7	191 aa		18.95	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.95	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		18.95	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	GBP4	Q96PP9	640 aa		18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.94	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	HAND2	P61296	217 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ST3GAL1	Q11201	340 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		18.93	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SEMA3E	O15041	775 aa		18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	MBD4	O95243	580 aa		18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	NECAB1	Q8N987	351 aa		18.92	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280		Q6ZUG5	572 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	XDH	P47989	1333 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	APP	P05067	770 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	RAI14	Q9P0K7	980 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		18.91	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	FBXO41	Q8TF61	875 aa		18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ARMT1	Q9H993	441 aa		18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF213	O14771	459 aa		18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	BRD1	O95696	1058 aa		18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		18.9	■□□□□ 0.62
DNM1-222	ENST00000636280	CYP7A1	P22680	504 aa		18.89	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		18.89	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	LAMA4	Q16363	1823 aa		18.89	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		18.89	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		18.89	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	DTNB	O60941	627 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	BBOX1	O75936	387 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MMP10	P09238	476 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GPSM2	P81274	684 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	LCORL	Q8N3X6	602 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	BRF1	Q92994	677 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		18.88	■□□□□ 0.61

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