RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 ARL4DP49703 201 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 STOML1Q9UBI4 398 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 USTQ9Y2C2 406 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 CLIP1P30622 1438 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 KIF27Q86VH2 1401 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 ADAM11O75078 769 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 ACPPP15309 386 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 C14orf37Q86TY3 774 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 BSNDQ8WZ55 320 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 OSMRQ99650 979 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 RNF208Q9H0X6 261 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 SOX13Q9UN79 622 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-215ENST00000583289 IGLV1-40P01703 118 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 GJD3Q8N144 294 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 MYRFLQ96LU7 910 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PRDM2Q13029 1718 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 EREGO14944 169 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 FZD6O60353 706 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ABL1P00519 1130 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 NXPE3Q969Y0 559 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 HHIPQ96QV1 700 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PRXQ9BXM0 1461 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP12P59046 1061 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 IKBKEQ14164 716 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 FDX2Q6P4F2 183 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 TRPA1O75762 1119 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 NFIAQ12857 509 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 MEGF11A6BM72 1044 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CD97P48960 835 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 RNF43Q68DV7 783 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CARNS1A5YM72 827 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ICMTO60725 284 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 COBLO75128 1261 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PREPP48147 710 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CUX1P39880 1505 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 HMX2A2RU54 273 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 NEFLP07196 543 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 BMP3P12645 472 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 SSTR4P31391 388 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 GRIK1P39086 918 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 BEND4Q6ZU67 534 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-215ENST00000583289 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 H3BRB1 525 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms