RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PRC1	O43663	620 aa		21.52	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FOSB	P53539	338 aa		21.52	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FAM89A	Q96GI7	184 aa		21.52	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ANO10	Q9NW15	660 aa		21.52	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQ27	194 aa		21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQ64	194 aa		21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQD8	194 aa		21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	IQCB1	Q15051	598 aa		21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF213	O14771	459 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FOXP2	O15409	715 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZAP70	P43403	619 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2B3	Q16720	1220 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ADAL	Q6DHV7	355 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	BRAP	Q7Z569	592 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FSIP1	Q8NA03	581 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf76	Q96K31	380 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	STRN4	Q9NRL3	753 aa		21.5	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	GUCY1B3	Q02153	619 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	METTL24	Q5JXM2	366 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	MYH7	P12883	1935 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	BECN2	A8MW95	431 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	CPLX1	O14810	134 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	GPAA1	O43292	621 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	HAND2	P61296	217 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		21.49	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	NEMF	O60524	1076 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	YEATS4	O95619	227 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	TRDN	Q13061	729 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	SCARF1	Q14162	830 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	SLAIN2	Q9P270	581 aa		21.48	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	STK38	Q15208	465 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA6	P23229	1130 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	PIGB	Q92521	554 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA3	Q99758	1704 aa		21.46	■■□□□ 1.03
RRN3-205	ENST00000563559	ATRN	O75882	1429 aa		21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	ADD2	P35612	726 aa		21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP10	Q86W26	655 aa		21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	SDF4	Q9BRK5	362 aa		21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		21.45	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	MCAM	P43121	646 aa		21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CTSW	P56202	376 aa		21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	ANTXR2	P58335	489 aa		21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	UBE3C	Q15386	1083 aa		21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CDKL5	O76039	1030 aa		21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	SPTLC2	O15270	562 aa		21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	PPFIA3	O75145	1194 aa		21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	LRMP	Q12912	555 aa		21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	GREM2	Q9H772	168 aa		21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		21.42	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	PI16	Q6UXB8	463 aa		21.42	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02

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