RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, humanhuman

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6A-208ENST00000561726 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 NXPE3Q969Y0 559 aa5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 CEP41Q9BYV8 373 aa5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 STOML1Q9UBI4 398 aa5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 SOX13Q9UN79 622 aa5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 RAXQ9Y2V3 346 aa5.12□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 USP5P45974 858 aa5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 WNT8BQ93098 351 aa5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.11□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 EDN3P14138 238 aa5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 EHHADHQ08426 723 aa5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 GJD3Q8N144 294 aa5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.1□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 HMX2A2RU54 273 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 IGLV1-40P01703 118 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 SSTR4P31391 388 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 ARL4DP49703 201 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 IKBKEQ14164 716 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC51AQ86UW1 340 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 BSNDQ8WZ55 320 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.09□□□□□ -1.59
TNRC6A-208ENST00000561726 METTL12A8MUP2 240 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 ICMTO60725 284 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 PREPP48147 710 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 SERPINB4P48594 390 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 ECM1Q16610 540 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 UVSSAQ2YD98 709 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 MYRFLQ96LU7 910 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 RNF208Q9H0X6 261 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 USTQ9Y2C2 406 aa5.08□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 H3BRB1 525 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 GSC2O15499 205 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 MED26O95402 600 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 TGFB1P01137 390 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 BMP3P12645 472 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 NFIAQ12857 509 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 USP26Q9BXU7 913 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.07□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 DLGAP3O95886 979 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 CD97P48960 835 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 PDE4CQ08493 712 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 RNF43Q68DV7 783 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 FDX2Q6P4F2 183 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.06□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 A0A1W2PP55 124 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 MEGF11A6BM72 1044 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 GSTM4Q03013 218 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 KCNA1Q09470 495 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 BEND4Q6ZU67 534 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.05□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 A0A096LPE4 126 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 A0A1W2PPZ6 126 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 COBLO75128 1261 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 GRIA4P48058 902 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 ARHGAP4P98171 946 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 CCDC27Q2M243 656 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 SGO2Q562F6 1265 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 CCNJLQ8IV13 435 aa5.04□□□□□ -1.6
TNRC6A-208ENST00000561726 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.04□□□□□ -1.6
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