RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1-218ENST00000556262 MSL1Q68DK7 614 aa22.29■■□□□ 1.16
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SDR39U1-218ENST00000556262 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.29■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 FOXP2O15409 715 aa22.29■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 GPAA1O43292 621 aa22.29■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.29■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 RUFY3Q7L099 469 aa22.29■■□□□ 1.16
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SDR39U1-218ENST00000556262 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.28■■□□□ 1.16
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SDR39U1-218ENST00000556262 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.28■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.27■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.27■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.27■■□□□ 1.16
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SDR39U1-218ENST00000556262 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SDR39U1-218ENST00000556262 MMP10P09238 476 aa22.27■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 PSMA5P28066 241 aa22.27■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 MAP3K12Q12852 859 aa22.27■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.27■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.26■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 IL27Q8NEV9 243 aa22.25■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.25■■□□□ 1.15
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SDR39U1-218ENST00000556262 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.25■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.25■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.25■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 ABCF2Q9UG63 623 aa22.25■■□□□ 1.15
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SDR39U1-218ENST00000556262 SLC15A2Q16348 729 aa22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 RPS6KB1P23443 525 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 KRT32Q14532 448 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 FGAP02671 866 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 GPSM2P81274 684 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 XDHP47989 1333 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 NEK1Q96PY6 1258 aa22.22■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 LARGE1O95461 756 aa22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.21■■□□□ 1.15
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SDR39U1-218ENST00000556262 HAND2P61296 217 aa22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1-218ENST00000556262 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.2■■□□□ 1.14
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SDR39U1-218ENST00000556262 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 STK32BQ9NY57 414 aa22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RAI14Q9P0K7 980 aa22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 LAMA4Q16363 1823 aa22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 E7EWF7 191 aa22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MBD4O95243 580 aa22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 JAG2Q9Y219 1238 aa22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PKP1Q13835 747 aa22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ARMT1Q9H993 441 aa22.19■■□□□ 1.14
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SDR39U1-218ENST00000556262 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.18■■□□□ 1.14
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SDR39U1-218ENST00000556262 APPP05067 770 aa22.18■■□□□ 1.14
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SDR39U1-218ENST00000556262 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 UFL1O94874 794 aa22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CYP7A1P22680 504 aa22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ME3Q16798 604 aa22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 LCORLQ8N3X6 602 aa22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF384Q8TF68 577 aa22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PTMSP20962 102 aa22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 BAG6P46379 1132 aa22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 GGA1Q9UJY5 639 aa22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CACNA1SQ13698 1873 aa22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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