RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556240.1

GPHN-212, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 404 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-212ENST00000556240 MED26O95402 600 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 EDN3P14138 238 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 CABP4P57796 275 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 NFIAQ12857 509 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 GJD3Q8N144 294 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 HMX2A2RU54 273 aa6.73□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 ACPPP15309 386 aa6.73□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.73□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 MYRFLQ96LU7 910 aa6.73□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 A6NHS1 94 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 TNFRSF21O75509 655 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 NLRP12P59046 1061 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 PIP4K2BP78356 416 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 WNT8BQ93098 351 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.72□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 ARHGAP4P98171 946 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 RNF43Q68DV7 783 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 BMP3P12645 472 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 GRIK1P39086 918 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 PREPP48147 710 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 IRAK1P51617 712 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 RNF208Q9H0X6 261 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 NFKBIEO00221 500 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 TRPA1O75762 1119 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 MAPK1P28482 360 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 FDX2Q6P4F2 183 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 BEND4Q6ZU67 534 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 HHIPQ96QV1 700 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.69□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 PRR19A6NJB7 356 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 PAX4O43316 350 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 SPINK2P20155 84 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 CHRDQ9H2X0 955 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 SOX13Q9UN79 622 aa6.68□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 EREGO14944 169 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ADAMTS4O75173 837 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ARL4DP49703 201 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 HGSNATQ68CP4 663 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 FAM129BQ96TA1 746 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 OSMRQ99650 979 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.67□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.66□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 IKBKEQ14164 716 aa6.65□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ECM1Q16610 540 aa6.65□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 DTX1Q86Y01 620 aa6.65□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.65□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.65□□□□□ -1.34
GPHN-212ENST00000556240 MEGF11A6BM72 1044 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 WDR64B1ANS9 1081 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 PLCB3Q01970 1234 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 SGO2Q562F6 1265 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 BSNDQ8WZ55 320 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 NXPE3Q969Y0 559 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 USP26Q9BXU7 913 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.64□□□□□ -1.35
GPHN-212ENST00000556240 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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