RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAMP50895 628 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC15A2Q16348 729 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD1Q15327 319 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 GRAPQ13588 217 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE4AQ14139 1066 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6KB1P23443 525 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 MSL1Q68DK7 614 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 LARGE1O95461 756 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 RASGRF1Q13972 1273 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 DOCK2Q92608 1830 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP10P09238 476 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 KLRK1P26718 216 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 GYG1P46976 350 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 MRE11P49959 708 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-211ENST00000539589 ME3Q16798 604 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA5Q8NB90 893 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 STK32BQ9NY57 414 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 BAG6P46379 1132 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 NEK1Q96PY6 1258 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBP2Q969R2 916 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 MAST3O60307 1309 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 STX6O43752 255 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 M0R2C6 588 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT1P21579 422 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP21A2P08686 494 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 GJB2P29033 226 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 NECAB1Q8N987 351 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 MBD3O95983 291 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 ADD2P35612 726 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 ST3GAL1Q11201 340 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 GPT2Q8TD30 523 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 WASHC4Q2M389 1173 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 APPBP2Q92624 585 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 SRGNP10124 158 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 GPSM2P81274 684 aa24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms