RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 FSCN2O14926 492 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 BSNDQ8WZ55 320 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 NPHS2Q9NP85 383 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC8Q09428 1581 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF428Q96B54 188 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 CSRNP1Q96S65 589 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 SOX13Q9UN79 622 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PP55 124 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 DOC2BQ14184 412 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 PIP4K2BP78356 416 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 EHD4Q9H223 541 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 METTL12A8MUP2 240 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ARL4DP49703 201 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 IKBKEQ14164 716 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 WNT8BQ93098 351 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 PLCB3Q01970 1234 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 CCNJLQ8IV13 435 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 A0A096LPE4 126 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PPZ6 126 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TREHO43280 583 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 FURINP09958 794 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 NOS3P29474 1203 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TCF12Q99081 682 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 DSC3Q14574 896 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ACAD11Q709F0 780 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ASB16Q96NS5 453 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.399e-6■■■■■ 50.1
PTPRC-214ENST00000530727 SYNJ1O43426 1573 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 F8W735 103 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ALX3O95076 343 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 MAPK8P45983 427 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 GRIA4P48058 902 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.392e-7■■■□□ 16.8
PTPRC-214ENST00000530727 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TM4SF5O14894 197 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 WISP1O95388 367 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP12P59046 1061 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 NESP48681 1621 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ADAM11O75078 769 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 HGSNATQ68CP4 663 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TP53INP1Q96A56 240 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TOP2BQ02880 1626 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 GLB1P16278 677 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 PCDH1Q08174 1060 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 GRM2Q14416 872 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 PI16Q6UXB8 463 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-214ENST00000530727 CUX1P39880 1505 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 GSTM4Q03013 218 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
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