RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-217ENST00000509355 H3BRB1 525 aa9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-217ENST00000509355 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-217ENST00000509355 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-217ENST00000509355 FAM129BQ96TA1 746 aa9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-217ENST00000509355 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-217ENST00000509355 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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PDE4D-217ENST00000509355 NLRP12P59046 1061 aa8.98□□□□□ -0.97
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PDE4D-217ENST00000509355 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.98□□□□□ -0.97
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PDE4D-217ENST00000509355 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-217ENST00000509355 SSTR4P31391 388 aa8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-217ENST00000509355 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-217ENST00000509355 HMX2A2RU54 273 aa8.92□□□□□ -0.98
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PDE4D-217ENST00000509355 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-217ENST00000509355 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-217ENST00000509355 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
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PDE4D-217ENST00000509355 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-217ENST00000509355 NPHS2Q9NP85 383 aa8.91□□□□□ -0.98
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