RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	PTPRA	P18433	802 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	CD96	P40200	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP11	P51784	963 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	HYAL2	Q12891	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	WNT8B	Q93098	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	ALG2	Q9H553	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	PSPN	O60542	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	DLGAP3	O95886	979 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	RELT	Q969Z4	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	GGN	Q86UU5	652 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	KIF4A	O95239	1232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGFBP4	P22692	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	MYO19	Q96H55	970 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	NFIC	P08651	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	CABP4	P57796	275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEP120	Q8N960	986 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	SCNN1A	P37088	669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEC13	P55735	322 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARRDC3-204	ENST00000507075	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAB6A	P20340	208 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	MCM6	Q14566	821 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075		U3KQE9	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	NFIB	O00712	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ACPP	P15309	386 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADH5	P11766	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAP7	Q14244	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	NFKBIE	O00221	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARL4D	P49703	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	NFKB2	Q00653	900 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNA10	Q16322	511 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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