RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.45□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.45□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.45□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 BBOX1O75936 387 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TERF1P54274 439 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ST5P78524 1137 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PTH1RQ03431 593 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 NECTIN1Q15223 517 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CHD4Q14839 1912 aa11.44□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CHGBP05060 677 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 BCAMP50895 628 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PALD1Q9ULE6 856 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 BRD1O95696 1058 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 NEK4P51957 841 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PI16Q6UXB8 463 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TMX3Q96JJ7 454 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 STK32BQ9NY57 414 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.43□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CASZ1Q86V15 1759 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SPEF2Q9C093 1822 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 MMP10P09238 476 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 RASGRF1Q13972 1273 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 RASEFQ8IZ41 740 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SPATA5Q8NB90 893 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SRGNP10124 158 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 UBE3CQ15386 1083 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TMC4Q7Z404 712 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 OSBP2Q969R2 916 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.41□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SEMA3EO15041 775 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 NPHP1O15259 732 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ADD2P35612 726 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 SP8Q8IXZ3 490 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.4□□□□□ -0.58
POLR1A-208ENST00000486964 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 NPR1P16066 1061 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 KLRK1P26718 216 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 PDE6BP35913 854 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 GYG1P46976 350 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 SLC51AQ86UW1 340 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 APPBP2Q92624 585 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 MAST3O60307 1309 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 XDHP47989 1333 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 FOXP2O15409 715 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 IGSF3O75054 1194 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 OFD1O75665 1012 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 GPSM2P81274 684 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.38□□□□□ -0.59
POLR1A-208ENST00000486964 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms