RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	METTL24	Q5JXM2	366 aa		5.84	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.84	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PDILT	Q8N807	584 aa		5.84	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	NFKBIE	O00221	500 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PLIN1	O60240	522 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ANXA1	P04083	346 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HUNK	P57058	714 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	SGSM3	Q96HU1	749 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	AOC3	Q16853	763 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CSAD	Q9Y600	493 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	DYTN	A2CJ06	578 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	INHBE	P58166	350 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GSTO1	P78417	241 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CASC1	Q6TDU7	716 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ABCC4	O15439	1325 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MYOM1	P52179	1685 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	C4A	P0C0L4	1744 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CREB3	O43889	395 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ECE2	O60344	883 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	RGS3	P49796	1198 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MICALL2	Q8IY33	904 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNA1	Q09470	495 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HSCB	Q8IWL3	235 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CHD4	Q14839	1912 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	FZD9	O00144	591 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GRM8	O00222	908 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TCF3	P15923	654 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CXCL9	Q07325	125 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HOXD10	P28358	340 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	IGBP1	P78318	339 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CAPNS2	Q96L46	248 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	LY75	O60449	1722 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TERF1	P54274	439 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CASZ1	Q86V15	1759 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PLCG2	P16885	1265 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNA3	P22001	575 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PAPPA	Q13219	1627 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGA6	P23229	1130 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GCKR	Q14397	625 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	VEZT	Q9HBM0	779 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	DOK7	Q18PE1	504 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	RGMB	Q6NW40	437 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	RINL	Q6ZS11	566 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	USP48	Q86UV5	1035 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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