RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WASHC4Q2M389 1173 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 H0YIN7 160 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TAF5LO75529 589 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BBOX1O75936 387 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SRGNP10124 158 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDE6BP35913 854 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPATA5Q8NB90 893 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APPBP2Q92624 585 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZAP70P43403 619 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RASSF7Q02833 373 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UBE3CQ15386 1083 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTLL6Q8N841 843 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCNB2Q92953 911 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLX4Q8IY92 1834 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SNED1Q8TER0 1413 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZBTB22O15209 634 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MCAMP43121 646 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHKA1P46020 1223 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NECTIN1Q15223 517 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKRD1Q15327 319 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 XDHP47989 1333 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NPR1P16066 1061 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTH1RQ03431 593 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STYK1Q6J9G0 422 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RRAGCQ9HB90 399 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC27A2O14975 620 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GNAT2P19087 354 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LMNB1P20700 586 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATP2B4P23634 1241 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ALDH1B1P30837 517 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADD2P35612 726 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APLP1P51693 650 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 VPS53Q5VIR6 699 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MASTLQ96GX5 879 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IL25Q9H293 177 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BCAMP50895 628 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RASGRF1Q13972 1273 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCARF1Q14162 830 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PALD1Q9ULE6 856 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WDR90Q96KV7 1748 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RUFY3Q7L099 469 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AIDAQ96BJ3 306 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAST3O60307 1309 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms