RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-208	ENST00000463118	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ME3	Q16798	604 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PTPRE	P23469	700 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	GJB2	P29033	226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	CSF1R	P07333	972 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PDC	P20941	246 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	DNAJB2	P25686	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PIGB	Q92521	554 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	BCL9	O00512	1426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ESPN	B1AK53	854 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	STARD3NL	O95772	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	RFC5	P40937	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	UBE2H	P62256	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	ITGB4	P16144	1822 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP9-208	ENST00000463118	SYCE3	A1L190	88 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CD46	P15529	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	COL9A1	P20849	921 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118		A0A1B0GUL7	405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	GOLIM4	O00461	696 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	SNPH	O15079	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	TIMM10	P62072	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CYP21A2	P08686	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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