RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 GREM2Q9H772 168 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 GPAA1O43292 621 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 FBXL16Q8N461 479 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ZNF213O14771 459 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 EVCP57679 992 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 MCAMP43121 646 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 NLRP10Q86W26 655 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 NCOA7Q8NI08 942 aa23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CTAGE5O15320 804 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 KINO60870 393 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ZNF75DP51815 510 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CAVIN2O95810 425 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 FSIP1Q8NA03 581 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ABCC12Q96J65 1359 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CTSWP56202 376 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 C8orf76Q96K31 380 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CPLX1O14810 134 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ANTXR2P58335 489 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 STX1AQ16623 288 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 BTG4Q9NY30 223 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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IMP4-208ENST00000460766 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ADD2P35612 726 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 APPP05067 770 aa23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 LRMPQ12912 555 aa23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 TRDNQ13061 729 aa23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 IQCB1Q15051 598 aa23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 ABCA3Q99758 1704 aa23.89■■□□□ 1.42
IMP4-208ENST00000460766 A0A087WWV3 80 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 STK38Q15208 465 aa23.88■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.88■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.88■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
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IMP4-208ENST00000460766 BECN2A8MW95 431 aa23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 PDE8BO95263 885 aa23.87■■□□□ 1.41
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IMP4-208ENST00000460766 A0A1B0GVL5 298 aa23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 ADALQ6DHV7 355 aa23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 FBXW7Q969H0 707 aa23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 NBPF3Q9H094 633 aa23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.87■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 CCDC102BQ68D86 513 aa23.86■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 SDF4Q9BRK5 362 aa23.86■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 ANO10Q9NW15 660 aa23.86■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.86■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 PHKA1P46020 1223 aa23.86■■□□□ 1.41
IMP4-208ENST00000460766 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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