RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445077.1

RBMS3-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RBMS3, Length 448 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS3-208	ENST00000445077	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	FANCC	Q00597	558 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TRDN	Q13061	729 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	NECTIN2	Q92692	538 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	IFNK	Q9P0W0	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	KIF5C	O60282	957 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CUTA	O60888	179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ZNF202	O95125	648 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	TXLNA	P40222	546 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	USP8	P40818	1118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CLCN6	P51797	869 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	STK3	Q13188	491 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ABTB2	Q8N961	1025 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM227B	Q96M60	508 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ADCY9	O60503	1353 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	PALLD	Q8WX93	1383 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SEMA3E	O15041	775 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SASH1	O94885	1247 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	BMP15	O95972	392 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC175	P0C221	793 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CPA1	P15085	419 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SYK	P43405	635 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SCRN1	Q12765	414 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	IL25	Q9H293	177 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077		A0A0D9SFI3	127 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	TRIM14	Q14142	442 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBMS3-208	ENST00000445077	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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