RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 BICD2Q8TD16 824 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD6Q9BX69 1037 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.851e-7■■□□□ 13.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCB1Q15051 598 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SARM1Q6SZW1 724 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 RASEFQ8IZ41 740 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PNMA2Q9UL42 364 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 BECN2A8MW95 431 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 IRF6O14896 467 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 HMMRO75330 724 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP6P59044 892 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf37Q96NL8 207 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CASZ1Q86V15 1759 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BQF6 201 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 EVCP57679 992 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 NECAB1Q8N987 351 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 IQUBQ8NA54 791 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP8B1O43520 1251 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 TADA3O75528 432 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 IVLP07476 585 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 GNAI3P08754 354 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17RAQ96F46 866 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS18Q9P253 973 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 BTAF1O14981 1849 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGB4P16144 1822 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1EQ8WY54 764 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 KCND1Q9NSA2 647 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PAX3P23760 479 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PPFIA4O75335 1185 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF4AO95239 1232 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 GSDMDP57764 484 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 HYPKQ9NX55 129 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CARNS1A5YM72 827 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 FBLN1P23142 703 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ST3GAL1Q11201 340 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC96Q2M329 555 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 MCTP2Q6DN12 878 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT8Q9BYC5 575 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SMC2O95347 1197 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 DCTN1Q14203 1278 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM212AQ96EL1 285 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PGBD1Q96JS3 809 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 BTG4Q9NY30 223 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 DONSONQ9NYP3 566 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXC9P31274 260 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 NBPF11Q86T75 865 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SUFUQ9UMX1 484 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 FANCGO15287 622 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CAVIN2O95810 425 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 TPM1P09493 284 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 CORO7P57737 925 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ME3Q16798 604 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC6Q7Z403 805 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-203ENST00000439720 SPG7Q9UQ90 795 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms