RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 AK2P54819 239 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP2B3Q16720 1220 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 MMRN1Q13201 1228 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CUL4AQ13619 759 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF20Q5VTR2 975 aa4.77□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.77□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 PARP10Q53GL7 1025 aa4.76□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 SEC31BQ9NQW1 1179 aa4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.76□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF609O15014 1411 aa4.76□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.76□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP33O14559 1287 aa4.76□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 PDE8BO95263 885 aa4.76□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 MCTP1Q6DN14 999 aa4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.75□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 WASHC4Q2M389 1173 aa4.75□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC152Q4G0S7 254 aa4.75□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.75□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.75□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.75□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.75□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 IL27Q8NEV9 243 aa4.75□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 M0R2C6 588 aa4.74□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 AMHR2Q16671 573 aa4.74□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC102BQ68D86 513 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SEPT12Q8IYM1 358 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LPIN2Q92539 896 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 NEK1Q96PY6 1258 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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