RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 RAB33AQ14088 237 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 CEP120Q8N960 986 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.96□□□□□ -1.45
RNU6-441P-201ENST00000384545 A0A096LPE4 126 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 A0A1W2PPZ6 126 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 VSIG8P0DPA2 414 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ACPPP15309 386 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ITPKAP23677 461 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPEM2Q0P670 501 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 STRN4Q9NRL3 753 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 MARK1Q9P0L2 795 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 METTL12A8MUP2 240 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRPA1O75762 1119 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 GDF11O95390 407 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 LMNB1P20700 586 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 BHMTQ93088 406 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 NXPE3Q969Y0 559 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZFP42Q96MM3 310 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 H7C1W4 665 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ENC1O14682 589 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 CRKP46108 304 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 NEUROD1Q13562 356 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 GRIN2CQ14957 1233 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SEZ6Q53EL9 994 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TNNI3KQ59H18 835 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SAMM50Q9Y512 469 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 NFKBIEO00221 500 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 BNIP3LO60238 219 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAN1A2O60476 641 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 NRLP54845 237 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SIK1P57059 783 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SHDQ96IW2 340 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 HHIPQ96QV1 700 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 CRBNQ96SW2 442 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC30A3Q99726 388 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PBX4Q9BYU1 374 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF576Q9H609 170 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SNTG2Q9NY99 539 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PPT2Q9UMR5 302 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ENPP3O14638 875 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 PAGE1O75459 146 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 F13A1P00488 732 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 THBS1P07996 1170 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 MCM4P33991 863 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF165P49910 485 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 CHMP4BP1P59074 171 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAAP100Q0VG06 881 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-441P-201ENST00000384545 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms