RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.92□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 STOML1Q9UBI4 398 aa8.92□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 ADAM11O75078 769 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 TRPA1O75762 1119 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 FSTP19883 344 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 ARHGAP4P98171 946 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 LRP8Q14114 963 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 HHIPQ96QV1 700 aa8.9□□□□□ -0.98
PDCL2-201ENST00000295645 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.89□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.88□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 MYRFLQ96LU7 910 aa8.88□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 FAM129BQ96TA1 746 aa8.88□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.88□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.88□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 NLRP12P59046 1061 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 FDX2Q6P4F2 183 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 CCNJLQ8IV13 435 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.87□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 A0A1W2PP55 124 aa8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 IGLV1-40P01703 118 aa8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 NBPF11Q86T75 865 aa8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.86□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 A0A096LPE4 126 aa8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 A0A1W2PPZ6 126 aa8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 BRD1O95696 1058 aa8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 TMC1Q8TDI8 760 aa8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 TCF12Q99081 682 aa8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PDCL2-201ENST00000295645 PCDH1Q08174 1060 aa8.83□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 RNF43Q68DV7 783 aa8.83□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.83□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 CYP11A1P05108 521 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 BMP3P12645 472 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 GSTM4Q03013 218 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 NFIAQ12857 509 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 HGSNATQ68CP4 663 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 USP26Q9BXU7 913 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.82□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 PREPP48147 710 aa8.81□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.81□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 EHD4Q9H223 541 aa8.81□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 ITPKAP23677 461 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 GRIA4P48058 902 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 BEND4Q6ZU67 534 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.8□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 METTL12A8MUP2 240 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 TIAF1O95411 115 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 IGHA2P01877 340 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 ORC1Q13415 861 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.79□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 COBLO75128 1261 aa8.78□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 GRIK1P39086 918 aa8.78□□□□□ -1
PDCL2-201ENST00000295645 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms