RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ABCF2Q9UG63 623 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TULP2O00295 520 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ARID5BQ14865 1188 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MAP4K1Q92918 833 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 XAGE2Q96GT9 111 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NFAT5O94916 1531 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 H7C1W4 665 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CAVIN2O95810 425 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CYP2C19P33261 490 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 C8orf37Q96NL8 207 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC69A6NI79 296 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TAF5LO75529 589 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ADORA1P30542 326 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HLFQ16534 295 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 RPS6KB1P23443 525 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ATG3Q9NT62 314 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NR1I2O75469 434 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 KCNQ4P56696 695 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NECTIN1Q15223 517 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 AIDAQ96BJ3 306 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HAUS7Q99871 368 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NWD1Q149M9 1564 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF213O14771 459 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 APOBRQ0VD83 1088 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 ST3GAL1Q11201 340 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 PI16Q6UXB8 463 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 LTN1O94822 1766 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 ZAP70P43403 619 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 NEK11Q8NG66 645 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 GREM2Q9H772 168 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 BECN2A8MW95 431 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 SARM1Q6SZW1 724 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 TEX35Q5T0J7 233 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 FOXO4P98177 505 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 JAK2O60674 1132 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CCZ1BP86790 482 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CYP21A2P08686 494 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 IQCB1Q15051 598 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 UTYO14607 1347 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CLCN6P51797 869 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 RAI14Q9P0K7 980 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 SNAP23O00161 211 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 SLC5A1P13866 664 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 ME1P48163 572 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 TDO2P48775 406 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB13-201ENST00000290295 STX1AQ16623 288 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms