RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc162pQ0VG85 912 aa17.56■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp28Q5I043 1051 aa17.56■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtmr3Q8K296 1196 aa17.56■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnq3Q8K3F6 873 aa17.56■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GakQ99KY4 1305 aa17.56■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf496Q5SXI5 585 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fsd1Q7TPM6 496 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FliiQ9JJ28 1271 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rgs12Q8CGE9 1381 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myh4Q5SX39 1939 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Med23Q80YQ2 1367 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ercc3P49135 783 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnot6lQ8VEG6 555 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ipo4Q8VI75 1082 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rcan1Q9JHG6 198 aa17.55■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep55Q8BT07 462 aa17.54■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc173A0JLY1 547 aa17.54■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdcl2Q78Y63 240 aa17.54■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PrkcshO08795 521 aa17.54■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700029H14RikE9PY36 240 aa17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap73J3QPZ5 306 aa17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpcn2Q8BWC0 731 aa17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CpdO89001 1377 aa17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mknk2Q8CDB0 459 aa17.53■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pla2g4fQ50L41 855 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem143Q8VD26 458 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm13023A2A8N2 498 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifit1Q64282 463 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Acap3Q6NXL5 833 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfml1Q8BSH2 233 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa17.52■□□□□ 0.4
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc43Q3V0L5 667 aa17.52■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Heg1E9Q7X6 1337 aa17.52■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lipo1J3QME6 396 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccng2O08918 344 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smarcc1P97496 1104 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anp32cQ64G17 123 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdcl3Q8BVF2 240 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Terf2ipQ91VL8 393 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspa1lP16627 641 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde6aP27664 859 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddrgk1Q80WW9 315 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ces1dQ8VCT4 565 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IcoslgQ9JHJ8 322 aa17.51■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stox1B2RQL2 990 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SrprbP47758 269 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Siah1aP61092 282 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gimap8Q75N62 688 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eaf2Q91ZD6 262 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb43Q9DAI4 467 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LyarQ08288 388 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc82Q6PG04 518 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VmacQ8BP01 174 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fsd2Q8BZ52 692 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Odf2lQ9D478 642 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lgr5Q9Z1P4 907 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp25P57080 1055 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc44a1Q6X893 653 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Naa16Q9DBB4 864 aa17.5■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubr3Q5U430 1889 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc112A0AUP1 442 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rhbdl3P58873 404 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcmtd1P59913 357 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp1b3P97370 278 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sirt2Q8VDQ8 389 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tulp1Q9Z273 543 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bicdl1A0JNT9 577 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CltaO08585 235 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hmx1O70218 332 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gnat2P50149 354 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ckap2Q3V1H1 664 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdca8Q8BHX3 289 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Emilin2Q8K482 1074 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxo3Q9WVH4 672 aa17.49■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stag1Q9D3E6 1258 aa17.48■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa17.48■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myh13B1AR69 1938 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.1 ms