RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM203	Q969S6	136 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ING4	Q9UNL4	249 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		12.02	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JK05	382 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CDRT1	O95170	752 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HTR3B	O95264	441 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP1	P28562	367 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HILS1	P60008	231 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FABP5	Q01469	135 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	AWAT2	Q6E213	333 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N7P7	452 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	MUL1	Q969V5	352 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CST11	Q9H112	138 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF69	Q9UC07	566 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SIRPB1	O00241	398 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1-69	P01742	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF728	P0DKX0	622 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINA2	P20848	420 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PSMB9	P28065	219 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	P2RX3	P56373	397 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	EDDM3B	P56851	147 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CORO2A	Q92828	525 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF14	Q92956	283 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OCEL1	Q9H607	264 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WXM4	84 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf98	A8MV24	154 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A1	O15245	554 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	BPNT1	O95861	308 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GLA	P06280	429 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CALCB	P10092	127 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CFP	P27918	469 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2E1	P51965	193 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	DLX6	P56179	175 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PIGY	Q3MUY2	71 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	LHX4	Q969G2	390 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF714	Q96N38	554 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A7	Q99884	636 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CHST6	Q9GZX3	395 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC17A2	O00624	439 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD5	O14737	125 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	MYL9	P24844	172 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HTR2C	P28335	458 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SCN1B	Q07699	218 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF273	Q14593	569 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ODAM	A1E959	279 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN34	H7C241	214 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49

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