RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 VBP1P61758 197 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 GRK1Q15835 563 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 GPR107Q5VW38 600 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 AIPO00170 330 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 GPR141Q7Z602 305 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 TPRA1Q86W33 373 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 GHRLQ9UBU3 117 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-201ENST00000309641 CRLF1O75462 422 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 GABARAPO95166 117 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 LIPFP07098 398 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 UBBP0CG47 229 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 GATA3P23771 443 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 CFPP27918 469 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 DLX6P56179 175 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 P2RX3P56373 397 aa7.47□□□□□ -1.21
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