RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.64□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 F8P00451 2351 aa11.64□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 MAST4O15021 2626 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 MED13LQ71F56 2210 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 TMEM82A0PJX8 343 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 IFITM5A6NNB3 132 aa11.63□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 SH2D1BO14796 132 aa11.63□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 NPY4RP50391 375 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 UNC119Q13432 240 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 GPR176Q14439 515 aa11.63□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 GRK1Q15835 563 aa11.63□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 BIVMQ86UB2 503 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 SLC25A28Q96A46 364 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 TMEM186Q96B77 213 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 C1orf159Q96HA4 380 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.63□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 15.2
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GGA3-216ENST00000583282 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 DEGS1O15121 323 aa11.62□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 PSPNO60542 156 aa11.62□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 ZNF737O75373 536 aa11.62□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 TK1P04183 234 aa11.62□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 FOSL1P15407 271 aa11.62□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 OR3A1P47881 315 aa11.62□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 PLA2G7Q13093 441 aa11.62□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 TPRA1Q86W33 373 aa11.62□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.62□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 MMP26Q9NRE1 261 aa11.62□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.62□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 ABCA1O95477 2261 aa11.61□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 CCDC160A6NGH7 325 aa11.61□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.61□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 CTF1Q16619 201 aa11.61□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 NHLRC3Q5JS37 347 aa11.61□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 SNX22Q96L94 193 aa11.61□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 K7N7A8 449 aa11.6□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 CD37P11049 281 aa11.6□□□□□ -0.55
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GGA3-216ENST00000583282 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 QRFPP83859 136 aa11.6□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 MPV17LQ2QL34 196 aa11.6□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 BRICD5Q6PL45 260 aa11.6□□□□□ -0.55
GGA3-216ENST00000583282 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.6□□□□□ -0.55
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