RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 Q8N7P7 452 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 KCNK15Q9H427 330 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 ZNF69Q9UC07 566 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 NUP50Q9UKX7 468 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 ING4Q9UNL4 249 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-211ENST00000548041 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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CS-211ENST00000548041 ZNF44P15621 663 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 PSMB9P28065 219 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GABRA5P31644 462 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 MTNR1BP49286 362 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 EDDM3BP56851 147 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 ERVFRD-1P60508 538 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SCN1BQ07699 218 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GRK1Q15835 563 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 AWAT2Q6E213 333 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 ELP2Q6IA86 826 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 ASCL4Q6XD76 172 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 OR8H2Q8N162 312 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 THRSPQ92748 146 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 LHX4Q969G2 390 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 CYYR1Q96J86 154 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SNX22Q96L94 193 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GFI1Q99684 422 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 METTL9Q9H1A3 318 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 PPA2Q9H2U2 334 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 OCEL1Q9H607 264 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 RHOFQ9HBH0 211 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 KPTNQ9Y664 436 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 JMJD1CQ15652 2540 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 DNHD1Q96M86 4753 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 A0A0G2JK05 382 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SHISA3A0PJX4 238 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SH2D1BO14796 132 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 IFNA2P01563 188 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SRMP19623 302 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 IL13RA2Q14627 380 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TRAM1Q15629 374 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 NEDD8Q15843 81 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GPR157Q5UAW9 335 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 OSR2Q8N2R0 312 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 PNKDQ8N490 385 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TEX29Q8N6K0 151 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 Q8NFD4 153 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 COQ2Q96H96 371 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 S100A13Q99584 98 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 BANF2Q9H503 90 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 ING3Q9NXR8 418 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 IL36GQ9NZH8 169 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GLS2Q9UI32 602 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 LRRC42Q9Y546 428 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PRD5 423 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PRF3 423 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PRM7 423 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 M0R1W7 72 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 CCRL2O00421 344 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 DEGS1O15121 323 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 TCF21O43680 179 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-211ENST00000548041 VENTXO95231 258 aa7.06□□□□□ -1.28
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