RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 CLDN18P56856 261 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ARG2P78540 354 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 SPOCK1Q08629 439 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 CLINT1Q14677 625 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RAB11BQ15907 218 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ZNF529Q6P280 563 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 LINGO2Q7L985 606 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 SSX7Q7RTT5 188 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 AAED1Q7RTV5 226 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ZNF546Q86UE3 836 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 COMMD1Q8N668 190 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 GJC3Q8NFK1 279 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 EXTL1Q92935 676 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 HAVCR1Q96D42 359 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 CSTL1Q9H114 145 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 MED13Q9UHV7 2174 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 MEGF11A6BM72 1044 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 NKX2-8O15522 239 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 KCNAB3O43448 404 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 SYT7O43581 403 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 SMPD2O60906 423 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 FBXO24O75426 580 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ADAP1O75689 374 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 DFFBO76075 338 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF708P17019 499 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 CTSSP25774 331 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 NTF4P34130 210 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 CX3CR1P49238 355 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 H2BFSP57053 126 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 HIST1H3AP68431 136 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 SRYQ05066 204 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ATP6V1FQ16864 119 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ACTBL2Q562R1 376 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF766Q5HY98 468 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 FAM166AQ6J272 317 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF774Q6NX45 483 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 WDR73Q6P4I2 378 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 SLC22A25Q6T423 547 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ABHD3Q8WU67 409 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 HAS2Q92819 552 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 TMEM45BQ96B21 275 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 RHOFQ9HBH0 211 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GTI1 187 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 GABARAPH6UMI1 98 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 ACOT7O00154 380 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 TM4SF5O14894 197 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 LMX1BO60663 402 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 GOSR1O95249 250 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 SYNGR4O95473 234 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 IL18BPO95998 194 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 RLN1P04808 185 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-204ENST00000546621 CD37P11049 281 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms