RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 SCN1BQ07699 218 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 FAM189A2Q15884 450 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 KLHL22Q53GT1 634 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 MALSU1Q96EH3 234 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 DHDHQ9UQ10 334 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CMYA5Q8N3K9 4069 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 VGLL3A8MV65 326 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 MMP23AO75900 390 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CCDC159P0C7I6 412 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 LIMS3P0CW19 117 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 LIMS4P0CW20 117 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 KIR2DS4P43632 304 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 P2RX3P56373 397 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 KISS1Q15726 138 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 MMP27Q9H306 513 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RAB18Q9NP72 206 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 SESN1Q9Y6P5 492 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 SULT1B1O43704 296 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CLIC3O95833 236 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TMEM225BP0DP42 221 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ZNF44P15621 663 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 EFNB2P52799 333 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ZP1P60852 638 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 DEFA6Q01524 100 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 AESQ08117 197 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 IL18R1Q13478 541 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 LPCAT4Q643R3 524 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 XAF1Q6GPH4 301 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ING3Q9NXR8 418 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 A0A0G2JK05 382 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ALX3O95076 343 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TSPAN15O95858 294 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 LMO1P25800 156 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 GLIPR1P48060 266 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 SOX2P48431 317 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ETV1P50549 477 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN26Q16670 478 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 Q6P435 159 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TMEM219Q86XT9 240 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 STMN2Q93045 179 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TMEM133Q9H2Q1 129 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TCF19Q9Y242 345 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CDK5R1Q15078 307 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 ZNF691Q5VV52 312 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RPS4Y2Q8TD47 263 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RDH12Q96NR8 316 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 JAM3Q9BX67 310 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 RHOFQ9HBH0 211 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-211ENST00000482015 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 A6NDX4 124 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 DEGS1O15121 323 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 RAB3AP20336 220 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 SLC34A1Q06495 639 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 HERPUD1Q15011 391 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 Q6ZTK2 550 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 SATL1Q86VE3 508 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-211ENST00000482015 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms