RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rap2aQ80ZJ1 183 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zer1Q80ZJ6 779 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekha1Q8BUL6 383 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C130079G13RikQ8BUY2 280 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl12Q8BZM0 568 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc119bQ8C4B4 251 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ThtpaQ8JZL3 224 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb44Q8R0A2 453 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8R1Y2 203 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 V1ra11Q8R2E6 318 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr516Q8VFZ5 314 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr796Q8VGJ1 310 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr686Q8VGX3 317 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pskh1Q91YA2 424 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan31Q9CQ88 210 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elovl7Q9D2Y9 281 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AmtnQ9D3J8 213 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sun5Q9DA32 373 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psma6Q9QUM9 246 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem176bQ9R1Q6 263 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abhd16aQ9Z1Q2 558 aa9.3□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrdcA0A0G2JEU3 153 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv12-89A0A0G2JGW8 112 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1039A2ARY0 319 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Proca1B0QZF7 307 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15446D3Z5Y8 553 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r16K7N775 303 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SparcP07214 302 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alox5apP30355 161 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NodalP43021 354 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GnrhrQ01776 327 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MitfQ08874 526 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gspt2Q149F3 632 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Yipf3Q3UDR8 347 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam57aQ5ND56 257 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxph2Q61199 261 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HlxQ61670 476 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vsig8Q6P3A4 417 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr890Q7TRD9 314 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam98bQ80VD1 429 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zadh2Q8BGC4 377 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrp12Q8BUJ9 858 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a41Q8BVN7 312 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ulbp1Q8HWA3 334 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r198Q8R263 300 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r233Q8R294 319 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r237Q8R296 289 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spsb4Q8R5B6 273 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1484Q8VEU6 315 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt16l1Q8VHN8 211 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D10Wsu102eQ9CX66 185 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssbp3Q9D032 388 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pfn4Q9D6I3 129 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Isoc2bQ9DCC7 210 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf7Q9WTZ1 113 aa9.29□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1223A0A1L1SU13 311 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr221B2RVX8 311 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem233D3Z1U7 110 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr585E9PXW4 318 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1510E9PZZ6 318 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-T10F6T1I5 379 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm28048F7BCN0 99 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r12G5E8G1 307 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10354K7N6A0 256 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3755K7N743 167 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emg1O35130 244 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab33bO35963 229 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cops3O88543 423 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabra6P16305 453 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gnb2P62880 340 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F7P70375 446 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TsxP70675 144 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpsab1Q02844 273 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-T22Q31615 379 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10384Q3UQ87 92 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC147527Q3V185 167 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adamts16Q69Z28 1222 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf329Q6GQR8 522 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lcn12Q6JVL5 193 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr2mQ6P6I6 366 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PnlipQ6P8U6 465 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EpopQ7TNS8 369 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr270Q7TS19 314 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spink6Q8BT20 105 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf322Q8BZ89 410 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem56Q8CGF5 276 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxn4Q8K3Q3 521 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abhd6Q8R2Y0 336 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr960Q8VET5 316 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1094Q8VF13 330 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr734Q8VFT4 313 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1052Q8VGR8 312 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dyrk3Q922Y0 586 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ing5Q9D8Y8 240 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fabp12Q9DAK4 132 aa9.28□□□□□ -0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufa9Q9DC69 377 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.4 ms