Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Pfn4Q9D6I3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pfn4Q9D6I3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pfn4Q9D6I3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pfn4Q9D6I3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pfn4Q9D6I3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pfn4Q9D6I3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pfn4Q9D6I3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pfn4Q9D6I3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pfn4Q9D6I3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pfn4Q9D6I3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pfn4Q9D6I3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pfn4Q9D6I3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Pfn4Q9D6I3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pfn4Q9D6I3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pfn4Q9D6I3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pfn4Q9D6I3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pfn4Q9D6I3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pfn4Q9D6I3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pfn4Q9D6I3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pfn4Q9D6I3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pfn4Q9D6I3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pfn4Q9D6I3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pfn4Q9D6I3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pfn4Q9D6I3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pfn4Q9D6I3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pfn4Q9D6I3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pfn4Q9D6I3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pfn4Q9D6I3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pfn4Q9D6I3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pfn4Q9D6I3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pfn4Q9D6I3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pfn4Q9D6I3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pfn4Q9D6I3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pfn4Q9D6I3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pfn4Q9D6I3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pfn4Q9D6I3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pfn4Q9D6I3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pfn4Q9D6I3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pfn4Q9D6I3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pfn4Q9D6I3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pfn4Q9D6I3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pfn4Q9D6I3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pfn4Q9D6I3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pfn4Q9D6I3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pfn4Q9D6I3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pfn4Q9D6I3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pfn4Q9D6I3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pfn4Q9D6I3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pfn4Q9D6I3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pfn4Q9D6I3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pfn4Q9D6I3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pfn4Q9D6I3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pfn4Q9D6I3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pfn4Q9D6I3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pfn4Q9D6I3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pfn4Q9D6I3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pfn4Q9D6I3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pfn4Q9D6I3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pfn4Q9D6I3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pfn4Q9D6I3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pfn4Q9D6I3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pfn4Q9D6I3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pfn4Q9D6I3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pfn4Q9D6I3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pfn4Q9D6I3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pfn4Q9D6I3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pfn4Q9D6I3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pfn4Q9D6I3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pfn4Q9D6I3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pfn4Q9D6I3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pfn4Q9D6I3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pfn4Q9D6I3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pfn4Q9D6I3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pfn4Q9D6I3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pfn4Q9D6I3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pfn4Q9D6I3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pfn4Q9D6I3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pfn4Q9D6I3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pfn4Q9D6I3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pfn4Q9D6I3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pfn4Q9D6I3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pfn4Q9D6I3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pfn4Q9D6I3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pfn4Q9D6I3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pfn4Q9D6I3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pfn4Q9D6I3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfn4Q9D6I3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pfn4Q9D6I3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pfn4Q9D6I3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pfn4Q9D6I3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfn4Q9D6I3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pfn4Q9D6I3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms