Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,31■■■□□ 2,6
Pfn4Q9D6I3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Pfn4Q9D6I3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Pfn4Q9D6I3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Pfn4Q9D6I3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Pfn4Q9D6I3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Pfn4Q9D6I3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Pfn4Q9D6I3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pfn4Q9D6I3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pfn4Q9D6I3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Pfn4Q9D6I3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pfn4Q9D6I3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Pfn4Q9D6I3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,64■■■□□ 2,01
Pfn4Q9D6I3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pfn4Q9D6I3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Pfn4Q9D6I3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Pfn4Q9D6I3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Pfn4Q9D6I3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pfn4Q9D6I3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pfn4Q9D6I3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Pfn4Q9D6I3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pfn4Q9D6I3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Pfn4Q9D6I3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pfn4Q9D6I3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pfn4Q9D6I3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Pfn4Q9D6I3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Pfn4Q9D6I3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Pfn4Q9D6I3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pfn4Q9D6I3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Pfn4Q9D6I3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pfn4Q9D6I3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pfn4Q9D6I3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Pfn4Q9D6I3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Pfn4Q9D6I3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Pfn4Q9D6I3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Pfn4Q9D6I3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pfn4Q9D6I3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Pfn4Q9D6I3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Pfn4Q9D6I3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Pfn4Q9D6I3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Pfn4Q9D6I3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Pfn4Q9D6I3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Pfn4Q9D6I3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pfn4Q9D6I3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Pfn4Q9D6I3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pfn4Q9D6I3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Pfn4Q9D6I3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Pfn4Q9D6I3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Pfn4Q9D6I3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Pfn4Q9D6I3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Pfn4Q9D6I3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Pfn4Q9D6I3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Pfn4Q9D6I3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Pfn4Q9D6I3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Pfn4Q9D6I3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Pfn4Q9D6I3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Pfn4Q9D6I3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Pfn4Q9D6I3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Pfn4Q9D6I3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Pfn4Q9D6I3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Pfn4Q9D6I3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Pfn4Q9D6I3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Pfn4Q9D6I3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Pfn4Q9D6I3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Pfn4Q9D6I3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Pfn4Q9D6I3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Pfn4Q9D6I3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Pfn4Q9D6I3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pfn4Q9D6I3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Pfn4Q9D6I3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pfn4Q9D6I3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Pfn4Q9D6I3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Pfn4Q9D6I3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Pfn4Q9D6I3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Pfn4Q9D6I3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Pfn4Q9D6I3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Pfn4Q9D6I3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Pfn4Q9D6I3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Pfn4Q9D6I3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Pfn4Q9D6I3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Pfn4Q9D6I3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Pfn4Q9D6I3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Pfn4Q9D6I3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Pfn4Q9D6I3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Pfn4Q9D6I3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Pfn4Q9D6I3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Pfn4Q9D6I3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Pfn4Q9D6I3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Pfn4Q9D6I3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Pfn4Q9D6I3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Pfn4Q9D6I3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Pfn4Q9D6I3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Pfn4Q9D6I3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,4 ms