Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ88

Tspan31, Tetraspanin-31, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan31Q9CQ88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Tspan31Q9CQ88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tspan31Q9CQ88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tspan31Q9CQ88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tspan31Q9CQ88 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tspan31Q9CQ88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tspan31Q9CQ88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tspan31Q9CQ88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tspan31Q9CQ88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tspan31Q9CQ88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tspan31Q9CQ88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tspan31Q9CQ88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tspan31Q9CQ88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tspan31Q9CQ88 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tspan31Q9CQ88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tspan31Q9CQ88 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tspan31Q9CQ88 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tspan31Q9CQ88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tspan31Q9CQ88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tspan31Q9CQ88 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tspan31Q9CQ88 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tspan31Q9CQ88 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tspan31Q9CQ88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tspan31Q9CQ88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tspan31Q9CQ88 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tspan31Q9CQ88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tspan31Q9CQ88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tspan31Q9CQ88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tspan31Q9CQ88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tspan31Q9CQ88 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tspan31Q9CQ88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tspan31Q9CQ88 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tspan31Q9CQ88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tspan31Q9CQ88 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tspan31Q9CQ88 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tspan31Q9CQ88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tspan31Q9CQ88 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tspan31Q9CQ88 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tspan31Q9CQ88 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tspan31Q9CQ88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tspan31Q9CQ88 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tspan31Q9CQ88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tspan31Q9CQ88 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tspan31Q9CQ88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tspan31Q9CQ88 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tspan31Q9CQ88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tspan31Q9CQ88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tspan31Q9CQ88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan31Q9CQ88 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan31Q9CQ88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan31Q9CQ88 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tspan31Q9CQ88 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tspan31Q9CQ88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan31Q9CQ88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan31Q9CQ88 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan31Q9CQ88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tspan31Q9CQ88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan31Q9CQ88 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan31Q9CQ88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan31Q9CQ88 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan31Q9CQ88 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tspan31Q9CQ88 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan31Q9CQ88 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan31Q9CQ88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan31Q9CQ88 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tspan31Q9CQ88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tspan31Q9CQ88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan31Q9CQ88 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan31Q9CQ88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan31Q9CQ88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tspan31Q9CQ88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan31Q9CQ88 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan31Q9CQ88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tspan31Q9CQ88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan31Q9CQ88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tspan31Q9CQ88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan31Q9CQ88 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tspan31Q9CQ88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan31Q9CQ88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan31Q9CQ88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tspan31Q9CQ88 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan31Q9CQ88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tspan31Q9CQ88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan31Q9CQ88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tspan31Q9CQ88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan31Q9CQ88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan31Q9CQ88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan31Q9CQ88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan31Q9CQ88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan31Q9CQ88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan31Q9CQ88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan31Q9CQ88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tspan31Q9CQ88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan31Q9CQ88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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