Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Psma6Q9QUM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Psma6Q9QUM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Psma6Q9QUM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Psma6Q9QUM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Psma6Q9QUM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Psma6Q9QUM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Psma6Q9QUM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Psma6Q9QUM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Psma6Q9QUM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Psma6Q9QUM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Psma6Q9QUM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Psma6Q9QUM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Psma6Q9QUM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Psma6Q9QUM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Psma6Q9QUM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Psma6Q9QUM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Psma6Q9QUM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Psma6Q9QUM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Psma6Q9QUM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Psma6Q9QUM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Psma6Q9QUM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Psma6Q9QUM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Psma6Q9QUM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Psma6Q9QUM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Psma6Q9QUM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Psma6Q9QUM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Psma6Q9QUM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Psma6Q9QUM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Psma6Q9QUM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Psma6Q9QUM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Psma6Q9QUM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Psma6Q9QUM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Psma6Q9QUM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Psma6Q9QUM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Psma6Q9QUM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Psma6Q9QUM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Psma6Q9QUM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Psma6Q9QUM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Psma6Q9QUM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Psma6Q9QUM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Psma6Q9QUM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Psma6Q9QUM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Psma6Q9QUM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Psma6Q9QUM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Psma6Q9QUM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Psma6Q9QUM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Psma6Q9QUM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Psma6Q9QUM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Psma6Q9QUM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Psma6Q9QUM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Psma6Q9QUM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Psma6Q9QUM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Psma6Q9QUM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Psma6Q9QUM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Psma6Q9QUM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Psma6Q9QUM9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Psma6Q9QUM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Psma6Q9QUM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Psma6Q9QUM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Psma6Q9QUM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psma6Q9QUM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Psma6Q9QUM9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Psma6Q9QUM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Psma6Q9QUM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psma6Q9QUM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psma6Q9QUM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psma6Q9QUM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Psma6Q9QUM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Psma6Q9QUM9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Psma6Q9QUM9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Psma6Q9QUM9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Psma6Q9QUM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Psma6Q9QUM9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Psma6Q9QUM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Psma6Q9QUM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Psma6Q9QUM9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Psma6Q9QUM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Psma6Q9QUM9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Psma6Q9QUM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Psma6Q9QUM9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Psma6Q9QUM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Psma6Q9QUM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Psma6Q9QUM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Psma6Q9QUM9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Psma6Q9QUM9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Psma6Q9QUM9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Psma6Q9QUM9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Psma6Q9QUM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Psma6Q9QUM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Psma6Q9QUM9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Psma6Q9QUM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Psma6Q9QUM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Psma6Q9QUM9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Psma6Q9QUM9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Psma6Q9QUM9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Psma6Q9QUM9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms