RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 PDZK1IP1Q13113 114 aa23.63■■□□□ 1.37
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SEMA3B-215ENST00000621029 PRR31Q5SQ13 230 aa23.63■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 WFDC12Q8WWY7 111 aa23.63■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SPACA5Q96QH8 159 aa23.63■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM82A0PJX8 343 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 H3BUX3 64 aa23.62■■□□□ 1.37
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SEMA3B-215ENST00000621029 GRK1Q15835 563 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 BRICD5Q6PL45 260 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf42Q8N5U0 333 aa23.62■■□□□ 1.37
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SEMA3B-215ENST00000621029 OR5AK2Q8NH90 309 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 APH1BQ8WW43 257 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SSX3Q99909 188 aa23.62■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 CHST6Q9GZX3 395 aa23.62■■□□□ 1.37
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SEMA3B-215ENST00000621029 RPSAP08865 295 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF728P0DKX0 622 aa23.61■■□□□ 1.37
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SEMA3B-215ENST00000621029 LINC01006Q8NI28 216 aa23.61■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 RDH12Q96NR8 316 aa23.61■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PPA2Q9H2U2 334 aa23.61■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 DHDHQ9UQ10 334 aa23.61■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa23.61■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ZFPL1O95159 310 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PAX6P26367 422 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 TGFBR2P37173 567 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 LY6EQ16553 131 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5D14Q8NGL3 314 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 CYGBQ8WWM9 190 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.6■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MGAM2Q2M2H8 2515 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 hADV38S2A0JD32 116 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 C17orf98A8MV24 154 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SIRPB1O00241 398 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SPIN3Q5JUX0 258 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 Q6ZSV7 163 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SERPINA12Q8IW75 414 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 TPRX1Q8N7U7 411 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52N4Q8NGI2 321 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 OR13D1Q8NGV5 346 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R35Q8TAP8 253 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF714Q96N38 554 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 HMG20AQ9NP66 347 aa23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SH2D1BO14796 132 aa23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MT-ND2P03891 347 aa23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 DLX6P56179 175 aa23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SCN1BQ07699 218 aa23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 LPCAT4Q643R3 524 aa23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF649Q9BS31 505 aa23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SEMA3B-215ENST00000621029 WBP4O75554 376 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 CLIC3O95833 236 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ARG1P05089 322 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM225BP0DP42 221 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF146Q15072 292 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF144BQ7Z419 303 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4S1Q8NGB4 309 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 MEGF9Q9H1U4 602 aa23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 SULT1B1O43704 296 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 PSPNO60542 156 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 IGKV1D-12P01611 117 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 LIMS3P0CW19 117 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 LIMS4P0CW20 117 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 CNIH3Q8TBE1 160 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 AJUBAQ96IF1 538 aa23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 MGST3O14880 152 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM4BO94953 1096 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 RBP4P02753 201 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV1-8P0DP01 117 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 SOX2P48431 317 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 PLA1AQ53H76 456 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC23Q5W5X9 447 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TREML4Q6UXN2 200 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC00312Q9Y6C7 94 aa23.55■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 IRGMA1A4Y4 181 aa23.54■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEB3O15480 346 aa23.54■■□□□ 1.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF44P15621 663 aa23.54■■□□□ 1.36
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