RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 MPC2O95563 127 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 GPANK1O95872 356 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 IFNA21P01568 189 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SERPINA5P05154 406 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CXCL2P19875 107 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 AMY2BP19961 511 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PSMB6P28072 239 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 MPGP29372 298 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 HRH1P35367 487 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 MAGEB1P43366 347 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A9P48067 706 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CYB561P49447 251 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ARFRP1Q13795 201 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SMCO1Q147U7 214 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RSU1Q15404 277 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 AANATQ16613 207 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TREML4Q6UXN2 200 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 LINC00596Q86U02 117 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SULF2Q8IWU5 870 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR5AS1Q8N127 324 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PXT1Q8NFP0 134 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 BEX1Q9HBH7 125 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 A8MXK9 166 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RNF223E7ERA6 249 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TMPRSS2O15393 492 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 EFNA2O43921 213 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SFT2D2O95562 160 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MPIG6BO95866 241 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 F10P00742 488 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RLN2P04090 185 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CRHP06850 196 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 UMODP07911 640 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 NMBP08949 121 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LYL1P12980 280 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 IL11P20809 199 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 VAMP1P23763 118 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SFTPDP35247 375 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RBP2P50120 134 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FUT6P51993 359 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CARD18P57730 90 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SORDQ00796 357 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GUCA2AQ02747 115 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SGCAQ16586 387 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CORO6Q6QEF8 472 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ASCL4Q6XD76 172 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FAM57BQ71RH2 274 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ST8SIA2Q92186 375 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ST8SIA4Q92187 359 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PIGTQ969N2 578 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A7Q99884 636 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SYT3Q9BQG1 590 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 EMC6Q9BV81 110 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PLK3Q9H4B4 646 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DECR2Q9NUI1 292 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RASL12Q9NYN1 266 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GPR132Q9UNW8 380 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms