RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 MALLQ13021 153 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM189A2Q15884 450 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 BAP18Q8IXM2 172 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SPSB1Q96BD6 273 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 STARD10Q9Y365 291 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GPR31O00270 319 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RDH5Q92781 318 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GHRLQ9UBU3 117 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GTF3C1Q12789 2109 aa15.5■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CADP27708 2225 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 A8MXK9 166 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CYTIPO60759 359 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRP3O75074 770 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MT-CO3P00414 261 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MEOX1P50221 254 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SPEM2Q0P670 501 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 C2orf50Q96LR7 162 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 M0R296 226 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GP1BAP07359 652 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LHX2P50458 406 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRDX4Q13162 271 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IKZF1Q13422 519 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 APH1AQ96BI3 265 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RAB18Q9NP72 206 aa15.49■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM74A7A6NL05 159 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF732B4DXR9 585 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHATP28329 748 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PCBD1P61457 104 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF345Q14585 488 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TM2D1Q9BX74 207 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 NMES1Q9C002 83 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SYNGR1O43759 233 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IFNA21P01568 189 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CYC1P08574 325 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 OMGP23515 440 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 HERV-K104P61576 105 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 BCO1Q9HAY6 547 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MED12LQ86YW9 2145 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 WISP2O76076 250 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CD59P13987 128 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CLDN18P56856 261 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARG2P78540 354 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 OR2T2Q6IF00 324 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IER2Q9BTL4 223 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ABI3Q9P2A4 366 aa15.48■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 K7EPK0 472 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ACTL6AO96019 429 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 AADACP22760 399 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MPZP25189 248 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 A0A1B0GW55 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MED6O75586 246 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SMCO1Q147U7 214 aa15.47■□□□□ 0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 Q6ZPA2 131 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.4 ms