RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 HKR1P10072 659 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MYL12AP19105 171 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CFPP27918 469 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 BPIFB3P59826 476 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ST3GAL4Q11206 333 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MKXQ8IYA7 352 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TPRX1Q8N7U7 411 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM80Q96HE8 168 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 IRGMA1A4Y4 181 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 HAX1O00165 279 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM4BO94953 1096 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PAX6P26367 422 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SAA4P35542 130 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 DLX6P56179 175 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC34A1Q06495 639 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 EDDM3AQ14507 147 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF529Q6P280 563 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TFAP2CQ92754 450 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM19Q96E16 107 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK6Q9HC98 313 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRPB1O00241 398 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 OMGP23515 440 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 EDDM3BP56851 147 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 GUCA2AQ02747 115 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 KISS1Q15726 138 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC58Q4VC31 144 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8IYB0 196 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8H2Q8N162 312 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52N1Q8NH53 320 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SGCDQ92629 289 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 HMG20AQ9NP66 347 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 NOX4Q9NPH5 578 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM181BA6NEQ2 426 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRPO00591 440 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OGG1O15527 345 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CYB5AP00167 134 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRM2P08172 466 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 COX7A1P24310 79 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OR3A1P47881 315 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 BMXP51813 675 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF146Q15072 292 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 NCR3LG1Q68D85 454 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR148Q8TDV2 347 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM106AQ96A25 262 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 AJUBAQ96IF1 538 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 VCXQ9H320 206 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MEIOCA2RUB1 952 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2H2O95918 312 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRR1P24046 479 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 IER3P46695 156 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2E1P51965 193 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RELBQ01201 579 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 BLMHQ13867 455 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GRK1Q15835 563 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF9Q16594 264 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ALX3O95076 343 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB3AP20336 220 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OR3A4PP47883 348 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf87Q6PH81 154 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms