RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MAGEA5P43359 124 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R46P59540 309 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DHRS13Q6UX07 377 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 BORCS8Q96FH0 119 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DDA1Q9BW61 102 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 AK3Q9UIJ7 227 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SFTPBP07988 381 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 HOXB5P09067 269 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DAOP14920 347 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CCNOP22674 350 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 LHX2P50458 406 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR1C1Q15619 314 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SPSB1Q96BD6 273 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 R4GN57 208 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RBP2P50120 134 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DCAF10Q5QP82 559 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 BAP18Q8IXM2 172 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 HLA-HP01893 362 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SPINK2P20155 84 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PTGER4P35408 488 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CLDN18P56856 261 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 AVPI1Q5T686 147 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RAB19A4D1S5 217 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MSGN1A6NI15 193 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TMEM42Q69YG0 159 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR51F2Q8NH61 342 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MT-CO3P00414 261 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CALHM1Q8IU99 346 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 NMES1Q9C002 83 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PCBD1P61457 104 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C14orf79Q96F83 325 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CLCC1Q96S66 551 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MIOXQ9UGB7 285 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C9JQL5 133 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR5H8P0DN80 308 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CHATP28329 748 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 NPBWR2P48146 333 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RNF141Q8WVD5 230 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RAB18Q9NP72 206 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZFP57Q9NU63 452 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TINAGQ9UJW2 476 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 GLI4P10075 376 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 F2RL1P55085 397 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 S100A10P60903 97 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PLGLB1Q02325 96 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RAB32Q13637 225 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CLINT1Q14677 625 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 UQCC3Q6UW78 93 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.1□□□□□ -0.63
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