RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NF1	P21359	2839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0G2JK05	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1W2PPK0	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C3orf80	F5H4A9	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		F8VVB4	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		F8VWA3	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		H7C1Q1	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	WNT9B	O14905	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	AIRE	O43918	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SCGN	O76038	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RBP4	P02753	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MAS1	P04201	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MSMB	P08118	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CALCB	P10092	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ARSB	P15848	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	EGR1	P18146	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB3B	P20337	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB6A	P20340	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GADD45A	P24522	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NPBWR2	P48146	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PITPNB	P48739	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	BPIFB3	P59826	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PAX8	Q06710	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RSU1	Q15404	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		Q6P435	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GAPT	Q8N292	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CORO2A	Q92828	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SNX22	Q96L94	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		Q96M66	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GPER1	Q99527	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0A6YYH2	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		A6NJ64	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		H3BSH0	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DVL1	O14640	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MGST3	O14880	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ADAM20	O43506	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NDUFB3	O43676	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CDRT1	O95170	752 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HAND1	O96004	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TK1	P04183	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	BCL3	P20749	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FUT3	P21217	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SDC2	P34741	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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