RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC3-202ENST00000373162 RDH12Q96NR8 316 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF114Q9Y508 228 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNTNA6NMZ2 147 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNAB3O43448 404 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 KDM4BO94953 1096 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP1B3P54709 279 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF626Q68DY1 528 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 OPALINQ96PE5 141 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 HMG20AQ9NP66 347 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PPH5 198 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 VGLL3A8MV65 326 aa14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 TGFBR2P37173 567 aa14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 ZP1P60852 638 aa14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 LPCAT4Q643R3 524 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 TREML4Q6UXN2 200 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SSX3Q99909 188 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 MTCP1P56278 107 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 XAF1Q6GPH4 301 aa14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 Q96MT0 163 aa14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 BTBD17A6NE02 478 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM212A6NML5 194 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHST1O43916 411 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF20P17024 532 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 COX7A1P24310 79 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 DUSP1P28562 367 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 RFT1Q96AA3 541 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 RHOFQ9HBH0 211 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 EDDM3BP56851 147 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF691Q5VV52 312 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 BRICD5Q6PL45 260 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF714Q96N38 554 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-202ENST00000373162 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PPE2 198 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PR64 198 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PRV1 198 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 MMP23AO75900 390 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR2H2O95918 312 aa14.53□□□□□ -0.08
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